Các bị can bị truy tố về tội "Rửa tiền", "Vi phạm quy định về nghiên cứu, thăm dò, khai thác tài nguyên", "Lợi dụng chức vụ và quyền hạn trong khi thi hành công vụ".
Các bị can khác ngoài cựu Bí thư Tỉnh ủy Lào Cai Nguyễn Văn Vịnh gồm Doãn Văn Hưởng, cựu Chủ tịch UBND tỉnh Lào Cai; Mai Đình Định, cựu Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường; Nguyễn Thanh Dương, cựu Phó Chủ tịch UBND tỉnh; Lê Ngọc Hưng, cựu Phó Chủ tịch UBND tỉnh; Phan Văn Cương, cựu Phó Giám đốc Sở Công thương; Ngô Đức Hoàng, chuyên viên Phòng Kế hoạch - Tài chính Cục Địa chất Việt Nam; Lê Ngọc Dương, nguyên Trưởng phòng Quản lý khoáng sản, nguyên Phó Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh; Nguyễn Mạnh Thừa, Giám đốc Công ty Lilama; Nguyễn Quang Huy, nguyên Tổng Giám đốc Công ty Apatit; Phạm Cao Khiêm, cựu Phó Tổng giám đốc Công ty Apatit; Nguyễn Ngọc Bích, cựu Chủ tịch Hội đồng thành viên Công ty Apatit; Lương Văn Na, cựu Phó Tổng giám đốc Công ty Apatit; Cao Văn Tham, cựu Phó Trưởng phòng kế hoạch thị trường Công ty Apatit; Nguyễn Văn Bình, nguyên thành viên Hội đồng thành viên Công ty Apatit và Nguyễn Văn Chung, cựu phó trưởng phòng an toàn và môi trường, Công ty Apatit.
Theo cáo trạng, trên cơ sở kết quả điều tra xác định, từ năm 2012 – 2015, các bị can nguyên là lãnh đạo UBND tỉnh và một số sở, ngành liên quan biết rõ diện tích 3,77ha tại thôn 2, xã Đồng Tuyển (TP Lào Cai, tỉnh Lào Cai) thuộc khai trường 18 đã được Bộ Công thương phê duyệt quy hoạch quặng Apatit tại Quyết định số 28 ngày 18/8/2008 và thẩm quyền cấp phép khai thác khoáng sản tại đây thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường nhưng đã lợi dụng chức vụ, quyền hạn của mình làm trái công vụ, ký các văn bản, giấy chứng nhận đầu tư trái quy định của pháp luật cho Công ty TNHH Xây dựng thương mại Lilama (Công ty Lilama) xây dựng dự án khách sạn, nhà hàng.
Theo đó đã tạo điều kiện cho các bị can thuộc Công ty Lilama và Công ty TNHH MTV Apatit Việt Nam (Công ty Apatit) khai thác và tiêu thụ trái phép hơn 1,5 triệu tấn quặng Apatit trị giá hơn 610 tỷ đồng, thu lợi bất chính hơn 350 tỷ đồng.
